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寧德市疾病預防控制中心致病菌基因測序工作外包服務項目掛網議價公告(NDCDC2024003)

所屬地區:福建 - 寧德 發布日期:2024-08-05
所屬地區:福建 - 寧德 招標業主:登錄查看 信息類型:招標公告
更新時間:2024/08/05 招標代理:登錄查看 截止時間:登錄查看
咨詢該項目請撥打:15055702333
各潛在供應商:
(略)因工作需要采購致病菌基因測序工作外包服務,(略)議價方式:(略)
一、采購項目:(略)致病菌基因測序工作外包服務項目。
二、采購數量:全基因組測序服務及菌種鑒定分析服務100份,單價600元/份,計(略);宏基因組測序項目50份,單價800元/份,計(略)
三、采購預算:10萬元。
四、采購方式:(略)
五、采購內容及要求:
(一)全基因組測序服務及菌種鑒定分析服務
1.樣品接收:
配備專人負責樣品的收集及運輸,根據客戶需求實時收取樣品,樣品需采用干冰進行運輸,保障實驗室樣品的質量不因運輸過程而受損。(項號1)
2.實驗室要求:
(略)(略)和數據分析能力。實驗室需通過ISO系列資質認證,(略)(略)(略)。(項號2)
3.數據要求:
(1)交付數據包括原始數據(rawdata和cleandata,數據格式為fastq)及分析結果。(項號3)
(2)(略),文庫長度在250~350bp之間,采用PE150(雙端測序,單向讀長150bp)及以上測序模式。(項號4)
(3)原始數據量(堿基數)≥1.2G,Q20高質量數據量(Cleandata)≥1G,堿基數據質量值Q30比例≥85%。(項號5)
(4)覆蓋度:堿基類型分布均勻,無GC分離;基因組10×覆蓋度≥95%,(略)6)
(5)項目要求拼接后SCAFFOLD數量<100個,Contig數量<100個。(項號7)
(6)具體分析內容
二代測序質量評估和質控;基因組拼接;基因元件預測;基因功能注釋;NR庫比對注釋;COG功能分類注釋;GO功能分類注釋;KEGG功能分類注釋;毒力因子注釋;耐藥功能注釋;碳水化合物活性酶注釋;病原宿主互作用;信號肽蛋白預測;脂蛋白預測;蛋白亞細胞定位;基于16SrRNA的系統發育樹;同源基因分析;泛基因組分析;(略)發育樹;同源基因Cluster的功能;血清型分析。(項號8)
(7)(略)數據需求。(項號9)
4.質控要求:
(1)每批樣品收到后應立即開始質量檢測等相應工作,核酸樣品自收到之日起,于3-5日內提供樣品質量檢測報告。(項號10)
(2)核酸樣品質量檢測結果:濃度不低于5ng/μl、總量不低于100ng,無嚴重RNA污染,無明顯降解。(項號11)
(3)樣品質量檢測合格,測序結果不合格的樣品,服務商需免費加測直至成功。(項號12)
5.周期要求:
50個樣本以內在14個工作日內完成,50-100個樣本在20個工作日內完成,之后每增加50個樣本,周期增加不超過5個工作日。(項號13)
6.數據交付及保存:
有專用的數據交付軟件,(略)絡下載的方式:(略)
(二)宏基因組測序項目
1.樣品接收:
配備專人負責樣品的收集及運輸,根據客戶需求實時收取樣品,樣品需采用干冰進行運輸,保障實驗室樣品的質量不因運輸過程而受損。(項號15)
2.實驗室要求:
(略)(略)和數據分析能力。實驗室需通過ISO系列資質認證,(略)(略)(略)。(項號16)
3.數據及分析要求:
(1)交付數據包括原始數據(rawdata和cleandata,數據格式為fastq)及分析結果。(項號17)
(2)(略),文庫長度在250~350bp之間,采用PE150(雙端測序,單向讀長150bp)及以上測序模式。(項號18)
(3)原始數據量(堿基數)≥6G,堿基數據質量值Q30比例≥85%,Q20≥90%。(項號19)
(4)樣本處理:由合適的MetaDNA提取試劑盒和處理方法獲得合格的DNA樣品。(項號20)
(5)文庫構建:根據標準SOP建庫流程完成文庫構建。(項號21)
(6)生物信息學分析內容:原始數據處理,宏基因組組裝、基因集構建、基因功能注釋、基差異基因分析、物種注釋與差異物種分析等。(項號22)
4.質控要求:
(1)每批樣品收到后應立即開始質量檢測等相應工作,核酸樣品自收到之日起,于3-5日內提供樣品質量檢測報告。(項號23)
(2)核酸樣品質量檢測結果:濃度不低于5ng/μl、總量不低于100ng,無嚴重RNA污染,無明顯降解。(項號24)
(3)樣品質量檢測合格,測序結果不合格的樣品,服務商需免費加測直至成功。(項號25)
5.周期要求:
50個樣本以內在20個工作日內完成,50-100個樣本在30個工作日內完成,之后每增加50個樣本,周期增加不超過5個工作日。
6.數據交付及保存:(項號26)
有專用的數據交付軟件,(略)絡下載的方式:(略)
六、供應商資格要求(供應商資格條件):
1.凡有能力提供本次議價文件所述服務((略)1-27)的,具有法人資格的國內供貨商或制造商均可能成為合格的供應商。需提交以下資質證明文件:
(1)供應商的合格營業執照(三證合一)副本復印件;
(2)法定代表人身份證(正反面的復印件);
(3)供應商代表人身份證(正反面的復印件),備注聯系電話:(略)
(4)法定代表人授權書原件(供應商代表是法定代表人無需);
2.供應商對近三年無行賄犯罪記錄進行聲明(格式自擬);3.供應商需提供參加政府采購活動前3年內在經營活動中沒有重大違法記錄的書面聲明和通過“信用中國”網站((略).cn)(略)(略).cn)信用信息查詢無嚴重違法失信行為信息記錄的打印件(或截圖)。
4.供應商近三年內未受到相關監管部門違規處罰、通報暫停、勒令整改、撤銷服務證書等情況,提供承諾函并加蓋供應商公章(格式自擬)。
5.供應商需提供財務狀況報告,依法繳納稅收和社會保障資金的相關材料:
①財務狀況報告:經審計2023年度的財務報告(包含資產負債表、利潤表、現金流量表),或其基本開戶銀行出具的資信證明;
②依法繳納稅收:提供投標截止時間前六個月(不含投標截止時間的當月)已依法繳納稅收的投標人任意一個月的繳納稅收證明材料。
③社會保障資金的相關材料:提供投標截止時間前六個月(不含投標截止時間的當月)中已依法繳納稅收的投標人任意一個月的繳交社會保障資金證明材料;
6.供應商具備履行合同所必需的設備和專業技術能力的證明材料
①具備履行合同所必需的設備:供應商提供辦公場所的場地證明材料(屬于自有產權的提供產權證復印件;非自有產權的提供場地租賃合同復印件,租賃期限不少于一年);
②具備專業技術能力:提供負責本項目的主要人員的名單、聯系電話:(略)
7.本項目不接受聯合體投標。
注:以上相關資質證明文件應屬法定有效期內的,若發生變更的,應按有關規定辦理完變更手續后方可參加報價,并以發證機關核準的變更為準,否則按無效報價處理。其復印件應是清晰的并加蓋供應商公章。
七、議價和響應文件時間及地點:(略)
(一)文件材料內容及順序
1.報價函
2.貨物說明一覽表
3.資格證明文件(含“第五點采購內容及要求”和“第六點供應商資格要求”所涉及的資質證明材料)
4.投標人提交的其他資料
注:本次投標材料一式三份,正本一份,副本二份。
(二)投標文件的密封、標記和遞交
1.投標文件要求獨立編制:必須用A4幅面紙張打須膠裝(永久性、無破壞不可拆分)裝訂成冊,并每蓋章,否則視為投標無效。
2.投標人應將投標文件(正本1份、副本2份)用信封密封,(略)、投標貨物名稱:(略)
3.每一密封信封上注明“于之(指投標邀請中規定的開標日期及時間)不準啟封.
(三)文件響應遞交時間:2024年8月6日上午8:00至2024年8月8日下午6:00(雙休日及法定節假日除外)
(四)文件響應遞交方式:(略)
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